El Parque Interjurisdiccional Marino Isla Pingüino se encuentra ubicado en la ecorregión Mar Argentino

Templado frío, árido a semiárido. La temperatura media anual es de 9,8º C, con mínimas invernales bajo cero y máximas estivales por encima de los 35º C. Las precipitaciones alcanzan, aproximadamente, los 250 mm, concentrados en otoño e invierno. Vientos presentes casi todo el año, predominantes del oeste. La velocidad media de los mismos es de 31 km/h y máxima de 148 (en enero que es el mes más ventoso).

La notable biodiversidad presente en esta zona tiene su explicación en la riqueza en nutrientes que aporta el mar, punto de partida para una interesante red que se teje a partir del abundante fitoplacton, base alimenticia, directa o indirecta, para gran cantidad de animales. La zona resulta parte importante del ciclo de vida de especies como la merluza austral, el langostino patagónico y el calamar, todas de relevancia económica. En las islas, y en particular en Isla Pingüino se aposentan un sinnúmero de aves costero marinas. Allí es posible ver gaviotines sudamericanos, la gaviota austral y a los cormoranes gris y roquero. Los pingüinos de Magallanes también recalan en la isla para nidificar. Sin embargo, cada mes de octubre recala otra especie: Los pingüinos de penacho amarillo (Eudyptes chrysocome), que llegan para nidificar y permanecen hasta abril. Es la zona más austral y cerca del continente a dónde llegan y se convierten en la estrella de la región. En la Isla, también están los restos de un Faro de un siglo, hoy convertido en el ámbito reparado para los nidos de los Pinguinos de Magallanes, y restos de lo que fue una antigua factoría. Los cielos son surcados por esos extraordinarios viajeros alados, los petreles y los albatros. Y en los islotes y peñones en el mar, permanecen colonias de lobos marinos de un pelo y de elefantes marinos, la foca más grande del mundo.